تم افتتاح الجامع عام 1012 م. م وحصلت على اسمها من الحاكم ، وعام 1013 د. ج- أصدر قراراً بتحويل المسجد إلى “مسجد” يُدرس فيه الفقه ، وذلك لإيواء العلماء والمصلين.
مسجد الحاكم بأمر الله هو رابع أقدم مسجد جامعي في مصر وثاني أكبر مسجد في القاهرة بعد ج.
يقع المسجد في نهاية حي الجمالية بجوار باب الفتوح. حيث كان المسجد وقت بنائه خارج أسوار القاهرة القديمة الذي بناه جوهر الصقلي ، ثم جاء لاحقًا ضمن حدود المدينة بعد أن قام بدر الجمالي (480 هـ / 1087 م) بتوسيع المدينة وبنائها. الجدران الحالية.
بعد خمس سنوات من الترميم ، أعيد افتتاح المسجد القديم ليشكل إضافة قوية لآثار مصر الإسلامية في المنطقة التاريخية بالقاهرة ، والتي تتميز بمكانتها ودورها السياحيين المهمين ، بحسب وزير السياحة والآثار. أحمد عيسى خلال حفل افتتاح المسجد.
تم تنفيذ مشروع ترميم وتنشيط المساجد بالتعاون مع وتحت إشراف قطاعات الآثار والمشاريع الإسلامية والقبطية واليهودية بالمجلس الأعلى للآثار والإدارة العامة للقاهرة التاريخية بتكلفة 850 مليون جنيه.
أكد محافظ القاهرة خالد عبد العال ، أن مشروع ترميم المسجد جزء من التطوير الذي يشهده خلال الفترة الحالية حيث شهد افتتاح شارع الأشراف وطريق البيت ، بالإضافة إلى مشروع التطوير الجاري. .
أوضح رئيس المجلس الأعلى للآثار مصطفى وزيري ، أن مشروع الترميم بدأ في فبراير 2017 ، حيث اشتملت الأعمال على الصيانة الدورية لتلافي الأخطار وحماية جدران المسجد من تأثير الرطوبة والأملاح ، بالإضافة إلى التهوية. وتقوية الحوائط ومعالجة بعض التشققات فيها.
كما تضمن المشروع ترميم كافة الأعمال الخشبية للمسجد من أبواب ومنبر وأربطة خشبية زخرفية أسفل أسقف المسجد وترميم ثريات (النجف) في إيوان القبلة وصيانتها وإنجازها. الكوات والفوانيس الزجاجية في إيوانات المسجد ، وإضافة فوانيس جديدة كوحدات إنارة تواجه الفناء ، وكذلك الترميم الدقيق للمنافذ في المسجد مع تغيير الستائر التي تغطي فتحات المسجد العقود التي تواجه الفناء. الفناء ، وتجديد الشبكة الكهربائية الداخلية والخارجية ، وزيادة كفاءة الشبكة ، ومزود بنظام كاميرات المراقبة مع صيانة الإنارة المتخصصة للواجهة الخارجية ، بالإضافة إلى صيانة جميع أرضيات الأيونات والرخام. باحة المسجد وفق الأسس الفنية والأثرية.
يتميز مسجد الحكيم بأمر الله بمدخله الرئيسي البارز على الواجهة الرئيسية – الشمال الغربي ، وهو أقدم مثال على المداخل البارزة في مصر ، حيث أخذ الفاطميون فكرتهم من مسجد المهدية في تونس. .
أما تصميم المسجد فهو عبارة عن مساحة شبه مربعة يتوسطها فناء سماوي مكشوف محاط بأربع مظلات أكبرها وأوسعها قبة القبلة من الجهة الجنوبية الشرقية وتتكون من خمس أروقة. أما المظلة الشمالية الشرقية فهي تتكون فقط من رواقين وثلاثة أروقة ، ولكل رواق مجموعة من الأقواس ، وتعلو واجهته الرئيسية مئذنتان.
تم ترميم المسجد وترميمه بعد أن دمرت أجزاء منه بسبب زلزال مدمر في عام 1302. استولى عليه الجنود كمقر لهم في أواخر القرن الثامن عشر ، مستخدمين مئذنته كأبراج مراقبة عسكرية.
تم استخدام رواق القبلة والفناء من قبل لجنة الحفاظ على الآثار العربية كأول ما سمي دار الآثار العربية ، قبل نقل القطع إلى باب الخلق ، والرواق الجنوبي الغربي وجزء من تم تحويل الرواق الشمالي الغربي إلى مدرسة ابتدائية تعرف باسم “ابتدائية سلهدار”.
وتجدر الإشارة إلى أن القائد الشعبي عمر مكرم رمم بعض أجزاء المسجد وغطّى القبلة بالرخام مضيفًا منبرًا ومحرابًا إلى جوارها مطلع القرن التاسع عشر.